清修寺旧名塔庵,宋仁宗宝元元年(1038年)始正式建寺,治平豆年(1066年)宋英宗赐。南宋建炎三年(1129年)金兵过江,高宗赵构仓皇南逃,舟至海门,登清修寺,北望椒江,东大海,诗兴大发,索笔书“清修风景千年在,沧海烟岚一笑开”作为楹联,又在僧房题写了两首绝句。其一云:“古寺青山春更妍,长松修竹翠含烟。汲泉拟欲增茶兴,暂就房借眠。久坐方知春昼长,静中心地自清凉。人人圆觉何曾觉,但见勤劳尽日忙。”历代寺院有兴有衰,历经年月,寺院衰退。直至1987年5月,由释了安法师带领信众重修金刚殿、大雄宝殿、三圣殿、观音殿及新建藏经楼、寺院厢房等设施。